审计处是学校主管审计工作的职能部门。其主要职责是：

一、贯彻执行《中华人民共和国审计法》、《审计署关于内部审计工作的规定》、《中国内部审计准则》和《教育系统内部审计工作规定》《赣南医学院内部审计规定》等法律、法规以及学校的规章制度，在学校主管领导的指导下，依法独立开展内部审计工作，维护财经纪律，规范经济行为。

二、负责制定学校审计工作规章制度及工作计划并组织实施。

三、负责对下列事项进行审计：

（一）对学校及所属单位贯彻落实国家重大政策措施情况进行审计；

（二）对学校及所属单位发展规划、战略决策、重大措施以及年度业务计划执行情况进行审计；

（三）对校本级预算执行情况及决算情况进行审计；

（四）对学校内设机构及所属单位的财务收支、资产、负债、权益及其有关经济活动的真实性、合法性、效益性进行审计；

（五）对学校及所属单位固定资产投资项目进行审计；

（六）对学校内部管理领导干部履行经济责任情况进行审计；

（七）对学校及所属单位建设、修缮(含维修)工程项目进行审计；

（八）对学校及所属单位经济管理和效益情况进行审计；

（九）对学校及所属单位内部控制及风险管理情况进行审计；

（十）协助学校主要负责人督促落实审计发现问题的整改工作；

（十一）对学校所属单位的内部审计工作进行指导、监督和管理；

（十二）开展专项审计调查；

（十三）国家有关规定和学校领导要求办理的其他事项。

四、负责学校内部控制评价工作，牵头指导学校内部控制建设。

五、负责校内相关部门、单位财务收支及有关经济活动中出现的问题提供审计咨询服务。

六、组织审计人员参加岗位资格培训、后续教育及开展内部审计理论研讨。

七、整理审计资料，建立审计档案，做好保密工作。

八、完成学校领导和上级审计机构交办的其他审计事项。